Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms