Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NfascQ810U3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NfascQ810U3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms