Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc172Q810N9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms