Protein–RNA interactions for Protein: Q80UZ0

Fgd5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd5Q80UZ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgd5Q80UZ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd5Q80UZ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms