Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim12Q78RX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim12Q78RX3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms