Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc25Q78PG9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc25Q78PG9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc25Q78PG9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc25Q78PG9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc25Q78PG9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc25Q78PG9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc25Q78PG9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc25Q78PG9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc25Q78PG9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc25Q78PG9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc25Q78PG9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc25Q78PG9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc25Q78PG9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc25Q78PG9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms