Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nemp1Q6ZQE4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms