Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scgb2b2Q6UGQ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms