Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdf1Q6PIX5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdf1Q6PIX5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rhbdf1Q6PIX5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdf1Q6PIX5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms