Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx13Q6PHS6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx13Q6PHS6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms