Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup98Q6PFD9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms