Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd4Q6PDQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd4Q6PDQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms