Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zbtb39Q6PDK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbtb39Q6PDK0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbtb39Q6PDK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms