Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc2Q6PDG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms