Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trak1Q6PD31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trak1Q6PD31 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms