Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam222bQ6P539 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam222bQ6P539 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms