Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rtl3Q6P1Y1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl3Q6P1Y1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms