Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptpdc1Q6NZK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms