Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SphkapQ6NSW3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SphkapQ6NSW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SphkapQ6NSW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SphkapQ6NSW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SphkapQ6NSW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SphkapQ6NSW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms