Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt39Q6IFX4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt39Q6IFX4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt39Q6IFX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms