Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Best3Q6H1V1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Best3Q6H1V1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Best3Q6H1V1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms