Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbf1Q6DFZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms