Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swap70Q6A028 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Swap70Q6A028 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swap70Q6A028 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms