Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist2h2beQ64524 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2beQ64524 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist2h2beQ64524 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547.5 ms