Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprdQ64487 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms