Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp248Q640N4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp248Q640N4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp248Q640N4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zfp248Q640N4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp248Q640N4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp248Q640N4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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