Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd5Q640M6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd5Q640M6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd5Q640M6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms