Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab34Q64008 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab34Q64008 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab34Q64008 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms