Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock1Q62288 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock1Q62288 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock1Q62288 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms