Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox19Q62249 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox19Q62249 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox19Q62249 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms