Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Kdm5dQ62240 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Kdm5dQ62240 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Kdm5dQ62240 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Kdm5dQ62240 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm5dQ62240 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Kdm5dQ62240 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Kdm5dQ62240 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Kdm5dQ62240 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Kdm5dQ62240 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Kdm5dQ62240 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Kdm5dQ62240 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms