Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema5aQ62217 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema5aQ62217 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms