Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn9aQ62205 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn9aQ62205 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn9aQ62205 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn9aQ62205 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn9aQ62205 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn9aQ62205 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Scn9aQ62205 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn9aQ62205 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms