Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprrQ62132 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprrQ62132 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprrQ62132 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprrQ62132 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprrQ62132 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprrQ62132 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprrQ62132 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprrQ62132 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprrQ62132 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprrQ62132 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms