Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l1Q61985 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l1Q61985 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Nfe2l1Q61985 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Nfe2l1Q61985 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l1Q61985 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l1Q61985 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms