Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ltbp3Q61810 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp3Q61810 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp3Q61810 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms