Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcolceQ61398 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PcolceQ61398 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcolceQ61398 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcolceQ61398 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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