Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf235Q61116 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms