Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf3Q60980 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms