Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna1Q60960 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms