Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2cQ60772 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkn2cQ60772 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms