Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcf4Q60722 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcf4Q60722 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcf4Q60722 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms