Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nr2f1Q60632 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr2f1Q60632 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms