Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc2Q5XKE0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mybpc2Q5XKE0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mybpc2Q5XKE0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms