Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc125Q5U465 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc125Q5U465 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms