Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rabl6Q5U3K5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabl6Q5U3K5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabl6Q5U3K5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms