Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctc1Q5SUQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctc1Q5SUQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms