Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d4Q5RJF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d4Q5RJF7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms