Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn1r209Q5NC97 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r209Q5NC97 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r209Q5NC97 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms