Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynaQ5G5D5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynaQ5G5D5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms